Ενώ ορισμένες περιπτώσεις εγκεφαλίτιδας είναι ήπιες, άλλες μπορεί να οδηγήσουν σε σοβαρές νευρολογικές επιπλοκές, κώμα ή ακόμα και θάνατο.